Como vimos Louis XI instituiu a Ordem dos Cavaleiros de Saint-Michel! Este rei piedoso foi quatro vezes no Monte. Durante sua última visita, ele pediu para instalar a gaiola de ferro. O Mont Saint-Michel torna-se uma prisão. A partir de 1523, os monges eleito o líder mais. Ele é o rei, que é o novo abade, este é chamado a comenda. Geralmente, este padre não é padre, e ele é frequentemente apontado para desfrutar das receitas da abadia. Os monges, a partir daquela data não mais encontrar motivação em sua vida espiritual e, apesar de muitos peregrinos como eles sempre abandonar a abadia. Os monges, que eram até 60 na Prelazia de Robert Thorigny são apenas 13 em 1580. Em 1591, a ameaça de guerra terrível de religião se aproxima do Mont Saint-Michel. Os protestantes querem tomar a abadia. Sob as ordens de Montgomery, um grupo de homens que se aproximavam noite, ao pé da abadia. Não, pensando em obter a ajuda de um soldado inimigo comprou alguns dias antes, eles esperam que a elevação no interior do edifício. E, de fato, os protestantes breve encontrar-se em mais de 80 no mosteiro. Montgomery, surpreso de não ouvir o barulho de batalha dentro pede um de seus soldados mais fiéis a subir. Uma vez no porão, sem ver qualquer um de seus amigos, ele entende o regime e para evitar que seu chefe grita "Traição Traição!" Ouvindo isto os protestantes fugiram deixando para trás 98 deles.

Em 1594, um raio atingiu novamente no campanário da abadia. A seta é completamente destruída e uma parte da estrutura da igreja foi reduzido a cinzas. Padre se recusa a realizar os reparos, não era até 15 anos mais tarde que a torre é reconstruída. Abades que não estão interessados ??em sua abadia, os peregrinos que vêm monges menos fadiga e causa uma grande agitação no Monte. Em 1622, os monges foram substituídos por nove monges beneditinos da Congregação de Saint-Maur (os Maurists). Estes monges são muito cultivada. Desejando compartilhar seus conhecimentos, eles abriram uma escola onde uma dúzia de alunos que freqüentam as aulas. Infelizmente Maurists são construtores pobres. Em vez de reparar os três compartimentos da nave da igreja, que ameaçou entrar em colapso, eles demolir. No lugar do buraco deixado eles construir uma fachada de um estilo bastante feio.

O impulso dado pelas Maurists ter vida curta por causa do sistema comenda ruínas da abadia. Receita desabou mosteiro ea dívida monges. A precariedade da abadia é grande, a Revolução terminou a sua ruína. Em 1790, os monges são expulsos do mosteiro. Todos os bens são vendidos em 1792. Com a Revolução, o Mont Saint-Michel é uma prisão. A partir de 1792, 300 sacerdotes estão confinados dentro dos muros da abadia. Eles serão lançados em 1799. Em suas suítes internado condenados. Todos os quartos da abadia são transformados em oficinas. Os presos vão ser de até 700 trabalhando nessas peças, além de aumentar a área útil, um chão que separa a igreja. A administração penitenciária completamente abandona a manutenção de edifícios e, em 1817, o antigo hotel, construído durante o reinado de Robert Thorigny desmorona.

Em 1834, um incêndio na igreja da abadia convertido em um chapéu de oficina. O telhado foi destruído e as reparações são muito pequenas em comparação com a extensão dos danos. Todos os dias a abadia foi um pouco feio. Felizmente homens famosos, em sua maioria escritores (Hugo, Flaubert ...), atingidas por um desastre como esse, colocando pressão sobre o governo. Finalmente, em 1863, a prisão foi excluído. A abadia foi alugado para o Bispo de Coutances. Monges vivem no mosteiro de novo. Os peregrinos voltar animar o Mont Saint-Michel. Hotéis, restaurantes e lojas de souvenirs abrir novamente suas portas aos visitantes mais numerosos.

A ruína abadia que ameaça de todos os lados é classificada no registo de monumentos históricos em 1874. Os monges são expulsos de novo, mas desta vez por uma causa justa. O arquiteto Edouard Corroyer foi designada para realizar o trabalho de restauração. Esta é sua empregada Annette Poulard é a origem do famoso hoje sempre popular omelete. O trabalho de restauração dar o Mont Saint-Michel sua aparência atual em 1898, quando o boom terminou. Durante a celebração do milénio da Mont em 1966, monges formada uma pequena comunidade. Instalado na abadia casa, eles permanecem por um ano na ilha. A cidade, por sua vez recebe um fluxo constante de visitantes, 3 milhões por ano, e é também um agradecimento bits para que o Mont Saint-Michel é o que é hoje.